Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms