Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms