Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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