Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms