Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCHIP1Q9P0W5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms