Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM7SF3Q9NS93 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms