Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DLL4Q9NR61 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DLL4Q9NR61 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DLL4Q9NR61 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DLL4Q9NR61 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DLL4Q9NR61 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DLL4Q9NR61 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DLL4Q9NR61 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DLL4Q9NR61 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DLL4Q9NR61 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms