Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms