Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms