Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC12A9Q9BXP2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC12A9Q9BXP2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC12A9Q9BXP2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC12A9Q9BXP2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC12A9Q9BXP2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC12A9Q9BXP2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC12A9Q9BXP2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC12A9Q9BXP2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms