Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFHD1Q9BUP0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms