Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPZ7

MAPKAP1, Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPKAP1Q9BPZ7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPKAP1Q9BPZ7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms