Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBPF4Q96M43 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF4Q96M43 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms