Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MVB12AQ96EY5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms