Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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SEMA4DQ92854 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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