Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms