Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM41Q8WV44 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM41Q8WV44 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms