Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms