Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms