Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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