Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARMIL3Q8ND23 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms