Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms