Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC82Q8N4S0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC82Q8N4S0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms