Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPAP2Q8IXW5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms