Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms