Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms