Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP53Q70EK8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP53Q70EK8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP53Q70EK8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP53Q70EK8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP53Q70EK8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP53Q70EK8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP53Q70EK8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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