Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms