Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3CQ6NXT2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms