Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms