Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRRC8EQ6NSJ5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms