Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM208BQ5VWN6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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