Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP188Q5SRE5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms