Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms