Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms