Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIPR1Q53HC9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms