Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LETM2Q2VYF4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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