Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms