Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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NDUFA9Q16795 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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NDUFA9Q16795 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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NDUFA9Q16795 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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