Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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