Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms