Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms