Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC1Q13547 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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