Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD4Q13485 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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