Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms