Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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