Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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