Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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BNIP1Q12981 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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BNIP1Q12981 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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BNIP1Q12981 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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BNIP1Q12981 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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BNIP1Q12981 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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BNIP1Q12981 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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BNIP1Q12981 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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BNIP1Q12981 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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