Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNTN1Q12860 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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