Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms